апостиль на копии документов (практически любых) ставится после заверения нотариуса в минюсте, не только на оригиналы документов. Также Минюст проставляет апостили на некоторые оригиналы документов заверенные у нотариуса (например разрешение на выезд ребенка, доверенности, заявления и т.д.)
на оригиналы апостили ставят организации их выдавшие
все что выдает загс-проставляет загс
дипломы, аттестаты, вкладыши к ним - министерство образования
справка о несудимости-выдается региональным информационным центом ГУВД, апостилируется в МВД.