Возможно, паракоклюш, от него прививки не помогают. Делали РПГА на коклюш/паракоклюш? У меня дети этой гадостью заразились еще летом. До сих пор кашляют с переменным успехом.
Еще можно сдать анализ крови "для часто болеющих и кашляющих детей" стоит примерно 2,5 тысячи рублей (в хороших лабораториях именно такой анализ есть),где проверяют по нескольким параметрам. И как самый "экзотичный вариант" кашля может быть... паразитарный.