Мне кажется, 3 дня слишком мало, а планов у Вас слишком много... Только на Топкапы у Вас уйдет день часов 5, если не больше, потом голубая мечеть и Айя Софья - вот и один день закончился. А по Султанахмету еще хочетса так побродить... а еще есть базар, куда тоже стоит заглянуть... А еще есть Сулеймание, подземная улица... Конечно, Таксим, куда лучше идти днем, добраться до туда можно на машине, паром не нужен. А еще Эйюп и Пьер Лотти, ну и по-быстренькому на лодочке по Босфору... вот и все, прошло 3 дня.
По поводу чисто турецкой архитектуры, то Вам в Эйюп, мне кажется.
Принцевы острова оставьте на следующий раз. И вообще, не пытайтесь в 3 дня увидеть все, расслабьтесь и получайте удовольствие от Стамбула! По одному тока Султанахмету и дворцу Топкапы можно бродить несколько дней...
Да, кстати, не забудьте про баньку... Недавно открылась Hurrem hamami... очень красиво там, она прямо рядом с Голубой мечетью.
Ну еще советую вечерком заглянуть в кафе "Дервиш", там кальян хороший (кухня, конечно, так себе) ну и, если интересно, посмотреть на кружащегося дервиша, он конечно "искусственный"))), но все равно любопытно.